14年前，第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击，在世界上引发了前所未有的动荡。之后，前NERV成员，如葛成梅丽（三石琴配音）逃离并建立了Wille，Wille反抗Seele和NERV。
陆军高层关注局势，成立了陆军信息科陆军师，负责从饥饿、瘟疫和抢劫等“战争破坏”中重建。爱丽丝陛下，她每天都在为实现帝国贵族的复活和穷人的排斥而奋斗，并为实现贵族的复兴而奋斗。还有，奥兰多下士，拥有非凡的战斗能力，拥有神秘的秘密师的日历。他内心有着深深的创伤，通过一个新的环境来面对“战争破坏”，并与他的同胞交流，探索自己的道路。打破覆盖社会的欺骗和腐败的厚皮，打破其中的内容。因此，他们自己。用南瓜剪刀！
2010年，前小学生已经进入大学，太一、阿和等人走上了不同的人生道路（八神太一和石田大和将长大到22岁）。此时此刻，数字宝藏的研究人员Koji（松冈莫约配音）告诉他们，随着“被选中的孩子”长大，数字宝藏也会消失。
