Saint非常喜欢植物。带着这份爱,Saint隐瞒了自己的身份,来到了药用植物研究所工作。在这里,他遇到了善良的导演约翰(江口拓配音)和导师裘德(第八代拓配音)。在他们的帮助下,Saint的工作逐渐步入正轨。受圣母在圣体中的力量影响,圣地生产的所有药剂都有50%的收益,这逐渐奠定了圣灵的声誉,并在当地获得了信任。
故事从在九州乡下长大的浅葱空豆(广濑铃 饰)与梦想成为音乐家的青年海野音(永濑廉 饰)的命运般的相遇开始。原本以为一辈子都不会再见面的两人却在东京一处开始了合租生活,他们早已坠入爱河,却没有开始恋爱,仿佛处在白天和黑夜之间的暧昧而耀眼的“黄昏时分”。