1989年是日本昭和64年，但这一年并没有持续太久。随着天皇的去世，短暂的昭和64年很快结束了。在这短短的七天内，某个地方发生了一起绑架年轻女孩的案件。绑架者要求2000万日元的巨额赎金，并巧妙地与受害者家属和调查人员进行了安排。
在经历了第一季的平淡无奇，第二季的翻天复地后，动画版《魔法先生》第三季终于开学了！第三季全名为《魔法先生 涅吉！～白翼 ALA ALBA～》（魔法先生ネギま！～白き翼 ALA ALBA～），这次涅吉终于带领这帮问题学生平安过渡到初三。
秀之园学园是一所精英学校，聚集了众多学者。作为学生会的副主席，世工辉业会见了学生会主席白银玉行。我原以为这两个天才都觉得自己是对的，很快就会在一起，但他们的自尊心太强，无法向对方坦白。
