在一场车祸中，长井惠（佐藤贤三饰演）意外发现自己是个“亚洲人”。亚洲人拥有与人类相同的外表，拥有惊人的自我修复能力和永生。为了获得亚洲人的神秘力量，政府逮捕并监禁了今天被发现的亚洲人，包括吉永井，并对他们进行了残酷的活体实验。
20世纪中叶，第二次世界大战正处于如火如荼的关键时刻。此时，大不列颠帝国得到一条重要情报，拥有“代理总统”之称的纳粹头目少校（飞田展男 配音）正秘密发动一场扭转战局的重要战争，他所率领的部队据说全由嗜血如命、毫无人性的肉体怪物食尸鬼组成，一旦食尸鬼部队发起攻击，同盟国的优势将荡然无存，世界亦将进入最为黑暗的时刻。针对这一情况，皇家国教骑士团Hellsing宣誓誓死捍卫本土，而当时正青春年少却有着“死神”绰号的沃尔达•C•多内兹（朴璐美 配音）也带着恐怖的吸血鬼阿尔卡特飞抵英国上空，卷入了这场影响深远的世纪战争中。皇家国教骑士团的传奇就此拉开了序幕…… 本片根据平野耕太的原作改编，为《皇家国教骑士团》的外传。
在第二次新吉恩战争、别名“夏亚的叛乱”终结后，地球圈取得了短暂的和平。 这之后3年，宇宙世纪0096年。在工业殖民地“工业7号”上进行了一项秘密交涉。
