17世纪的关原之战,德川家族一统天下已成大势所趋,但是丰臣氏依然存有较强的实力。此后的日子里,双方的忍者集团爆发连番对决,平静的表象下战况激烈。在两大家族之外,始终宣称保持中立的真田家则成为整盘棋的关键。
21世纪初,人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上,仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆,前往能够移居的“约定之地·τ星e”。但这一计划失败,人类只得再度返回地球。
《游戏王》动画版,首先于1998年4月4日在日本的朝日电视台播放,共有27集,于1998年10月10日完播,是真正意义上的第一部游戏王动画。主要讲述漫画前期的黑暗游戏(闇のゲーム),直到第一次打莫良RPG为止,声优阵容超强。