2029年3月某日，某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵，众多外国使节及其同侪眷属沦为人质，事态十万火急。草薙素子（坂本真绫 配音）召集巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等得力属下，并制定了周密的营救计划。故事发生在未来世界，一种名为“巨大”的生命体凭空出现，将人类的命运带到了灭绝的边缘。此时此刻，世界各国联合起来发明了可以与庞格竞争的武器，而只使用这些武器的女孩名叫莉莉。这位胖邻居甚至有让妻子搭讪男主的想法。
