Kobe受警察厅副厅长Toyoki Kazumi(伊萨卡·宏饰演)指派,命令杉田和他的搭档Kazumy(奈良美子饰演)以调查谋杀案的名义前往凤凰岛,秘密调查生化武器的证据。特命二人组在民兵组织领导人真嗣(石原刚治饰演)的指导下抵达事故现场,而杉田则注意到事故背后似乎有一些人为因素。当他和随后到来的伊丹(川原和黑石饰演)逐渐接近真相时,这位诡计多端的政治家突然命令自卫队对他们采取行动
在参拜母亲坟墓的回程中,真嗣(绪方惠美配音)和川上隆(宫村洋子配音)遭到了第七使徒的袭击。在关键时刻,第二架飞机被强大的力量击败,真嗣也遇到了第二架机器的操作员Shibo Akira Langley(由宫村洋子配音)。
世界被四大公爵家族所掌控着,奥兹(皆川纯子 配音)是萨流士家的下一任当家,然而,在十五岁成人仪式上,他却因为“存在”这种莫名其妙的理由被定罪,之后被投入了永远不得超生的阿鬼茨监狱之中。