高中生大洋（三浦春马饰演）和朋友田口和小林一起去海边度过了一个漫长的暑假。他们原本计划住在田口海边的别墅里，但没想到一到就丢了钥匙。这太棒了，三个青少年最终陷入了无家可归的境地。
为了同这股势力抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的努力。 平日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩出现在了大家的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和刺激的日常就此展开。
最初，在平安时代，邪恶势力猖獗，并与人类进行了多次战争。为了消灭饥饿的鬼魂，元云带着被称为救世主的天童穿越时空。在最近的一场战斗中，天童为了营救同伴，无意中唤醒了自称能够消灭恶灵的八枝蛇。一次偶然的机会，他和大蛇救出了被贵族追捕的恶灵水野，从而发现了恶灵的真实面目。他作为救世主的信念也受到了动摇。。。这部电影改编自高田崇实的同名原作。
