谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美 饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
人类最终战争后的世界，大地被黑森林所覆盖，人类只能在被结界守护着的少许土地上生存。被病原体入侵的人类只要靠近天然的火身体就会燃烧，而唯一能够安全使用的火只能通过狩猎栖息在黑森林深处的黑色怪兽“炎魔”采集。
脱下你的鞋子和袜子，让你的赤脚感受地球的喜悦和芳香。脏不脏也没关系。印有破布的长裙在手风琴的欢乐中旋转着跳舞。陌生人，我从来没有见过像你这样绿色的眼睛。今晚，你不需要担心有地方休息，你能在我怀里安然入睡吗？摇摆的吉普赛人。
