一日，海人马琳（阿澄佳奈 配音）在海底捡到了一枚戒指，为了将它归还给失主，她和妹妹乌琳（堀江由衣 配音）来到陆地上，开始了一场大冒险。马琳顺利找到了戒指的主人宫守夏音（寿美菜子 配音），可是由于夏音的任性，戒指再度丢失。在寻找戒指的途中，马琳意外的打开了装载着邪恶力量的石棺，世界陷入了危机之中。与此同时，栖息在马琳和夏音体内的巫女力量也开始觉醒，作为“海之巫女”和“空之巫女”，女孩们能够战胜凶恶的幽灵吗？
故事从在九州乡下长大的浅葱空豆（广濑铃 饰）与梦想成为音乐家的青年海野音（永濑廉 饰）的命运般的相遇开始。原本以为一辈子都不会再见面的两人却在东京一处开始了合租生活，他们早已坠入爱河，却没有开始恋爱，仿佛处在白天和黑夜之间的暧昧而耀眼的“黄昏时分”。
