在这里，望美的身份是拥有神力万分尊贵的白龙神子，怨灵的存在导致了时空的扭曲，望美想要回到原来的世界只有一个方法，那就是不断的封印怨灵，提高自己的龙神之力。 外冷内热，总是在危急时刻挺身保护望美的源九郎（关智一 配音）、个性活泼主动，开朗乐观的西诺也（高桥直纯 配音）、博学多闻，举止稳重的武藏坊弁庆（宫田幸季 配音）、打扮华丽，举止轻浮，却对神子忠心耿耿的梶原景时（井上和彦 配音），在这些可靠的队友们的帮助下，望美能否成功回到自己的世界呢？
某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。 在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。
