故事紧接着上一部展开。菊川玲二（生田斗真 饰）接受了上级布置的新任务——接近并取得黑社会头目轰周宝（岩城滉一 饰）的信任，找到后者犯罪的证据。
When a mysterious figure began to target the evil of the national alchemist against God, the alchemist Edward Elric and his brother Alphonse were in the most vulnerable moment, at the same time, human beings began to unveil their own veil again.
港湾都市“里布拉市”。作为政治经济文化中心将城市中的“富”集结起来的“上城”，以及充斥着渎职和犯罪、人们不得不互相猜疑的“外围”，分隔这两个区域的巨大运河以及一座“桥”。由这些所构成，正可谓是将人类的“差别意识”表面化的城市。
