繁华大都会日本东京,迎来了一年一度的愚人节。有交流障碍的医院清洁工新田步(户田惠梨香 饰)鼓起勇气打电话给外科医生牧野亘(松坂桃李 饰),宣布自己已经怀孕的事实。谁知对方矢口否认孩子和自己相关,更当成一个恶劣的玩笑,之后继续招蜂引蝶。
然而,在安排宿舍时,负责此事的老师Shinasaka Ayanachi(浅仓昭配音)误将Yoshi认作女孩的名字,并将他分配到女孩的宿舍。如果尤希在女生宿舍的住处被学校发现,尤希将不可避免地被学校开除。为了弥补自己的错误,Ayanai老师主动提出帮助优希隐瞒自己的男性身份。与此同时,为了监视有希的一举一动,Ayanai老师安排有希住在自己的房间里。就这样,刚上高中的有希开始和这位漂亮的老师住在一起。
故事的时间设定在西元2001年,由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略,正面临灭亡的危机,因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”,各个国家均派遣了专门人员参与其中,该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 (有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.)