某日,野原新之助(矢岛晶子 配音)正在公园里和风间(真柴摩利 配音)、妮妮(林玉绪 配音)等朋友们玩耍,意外遇见了一位名为金有久美子(钉宫理惠 配音)的神秘女子,久美子告诉小新,自己来自于遥远的未来世界,而彼时已经长大成人的新之助,正是自己的未婚夫。 跟随着久美子,小新一行人来到了未来,在那里,金友电机的社长,亦是久美子的父亲金有增藏手握大权,并且绑架了一直和自己作对的新之助。得知小新的到来会阻碍自己的计划,增藏派出了刺客,在强大的敌人面前,小新能否顺利救出新之助,并且帮助面前这个陷入了黑暗之中的世界重新找回光明呢?
于是,齐木南雄封存了自己的超能力,全身心地投入到成为一个默默无闻的普通人中。然而,南雄七似乎发出的无线电波吸引了陌生的人。愚蠢顽皮的年轻人鸣人(小野大辅配音)、身患绝症的隼顺(岛崎信长配音)、无所畏惧的精神力量人物西本(花江夏树配音),从头到脚,完美的高桥真奈美(矢野爱一配音)从内到外闪耀,一次又一次地陷入困境。