在前一部作品中扮演学生水野直美的长泽亚美预计也将回到母校担任教师。
容姿端丽、最强无敌学生会长黑神目泷为你解决问题! 一年十三组的黑神目泷入选成为箱庭学园第98代学生会长,她在选举战中根据公约设立“意见箱”。 “你们的梦想是你们自己的所有物,自己挑战就要自己实现,但是,你们的烦恼是我的所有物,一点不剩全部交给我吧!!!” 于是,黑神和她的青梅竹马“人吉善吉”开始共同解决学生们投递的案件。意见箱人送外号“黑神箱”,获得学生们一致好评,但是……
每个人都有自己不想展现给别人的一面。这是一个情报战时代,世界各国都充分参与其中,但从表面上看,它们保持沉默。东西方国家已经卷入冷战十多年了。黄昏“是西方情报机构WISE旗下的一名高级间谍,专门与东方打交道。