数年后，在人类与“柱”持续战斗的天空中，身披战翼的女武神们以及支援者女武神的男人们，为了拯救世界而拼上性命翱翔天际。日本也不例外，与耸立于灵峰富士的巨大柱对峙的3名女武神。她们每个人都具备强劲的能力，但却都是些问题儿童。此时，一位王牌飞行员因某些缘由从欧洲前来…… “来吧，是反击的时候了，人类。终将来临的决战之日——诸神的黄昏已近在眼前。”
武里美姬（由宫泽隼配音）是一个诚实内向的女孩，性格非常内向。因为他不喜欢说话，生活中也交不到很多朋友，他认为这孤独的一天会一直陪伴她直到毕业。直到有一天，在一次偶然的机会中，明治遇到了一个叫古谷拓也的女孩（由高野马利卡配音）。
