被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”,并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。
龙二和女友小猪合理、平凡、幸福地经营着一家机车修理厂;另一方面,英吉进入了一所九流大学,过着自己的生活。怀着强烈的欲望,他计划成为一名教师,以便与大学女生勾搭!一次偶然的机会,英吉在培训主管内山和董事长的帮助下成功进入了高中教学。在这所有问题的高中里,英吉不仅要面对性格尴尬、战术不断古怪的学生,还要不断提防老师之间的冲突。这样一个格格不入的家伙,他能在这个看似平静的泥潭中生存下来吗?
但,唯有比丘兽即使进化为成长期,也依然表现出警戒…… “所以说过去的事情我不知道啦!” 面对比起自己更加优先关心他人的空的好意,比丘兽反而抱持着不信任感。 对于因受伤而久久伫立的空,太一和大和找不到能对她说的话语。 接下来,应该在数码世界做些什么才好—— 在商谈此事的众人面前,缅因猫兽突然现身,之后又消失了。他不知为何残留着原先的记忆,寻找着芽心,含泪彷徨着—— 看到这副景象,孩子们为了拯救缅因猫兽而对数码世界之旅下定了决心。但,他们的面前却出现了那个驱使黑暗四天王的男人的身影。 此时,现实世界的西岛收到了姬川失踪的报告。 调查此事的他,查出了姬川至今为止的行动背后隐藏着某个目的。 此事还关联着决定了两人命运的过去的某件事……