世界的中心，加特比亚，曾经是一个无尽而荒凉的恶魔王国。女神从天而降，天空中出现了一扇巨大的“门”。人们在“门”中发现了维持世界的奇迹之源；基里“；存在随着时间的推移，加特比亚发展成为一座城市。
Karul Abbas（华江夏树配音）也有着显赫的背景和悲伤的过去，他以平民的身份登上了Isla，和他没有血缘关系的妹妹Ariel（朱达·蔡奈配音）一起在Kegs高中学习航空。
某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
