与此同时，一项应用面部识别系统的“新技术”的测试也在进行中。。。另一方面，柯南和一支青年侦探队被邀请到公园观看八章岛上的鲸鱼。这时，柯南接到重亚昂（赤井水一饰）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国被琴久杀害。为了调查真相，柯南秘密潜入黑田警卫和其他前往“太平洋浮标”进行安保工作的警察乘坐的安保船，并进入该设施。之后，在稳步准备系统启动的设施中，发生了一起案件——一名女工程师被一个黑衣组织绑架，她的装有一定情报的U盘也落入黑衣组织手中。可怕的螺旋桨声从海里传来。而此时此刻，在八丈岛上的阿石原爱身边，也有一道黑影悄然靠近
另一方面，有另一个人被这个人的行为所吸引，它开始注意到潜意识中的某种东西觉醒了。这名男子是一名俄罗斯文学翻译家，独自生活在一个小岛上，横渡一艘小船。居民们谣传他是过去谋杀案的真凶。玛丽也有台湾父亲意外死亡，无法从痴迷中恢复过来的经历。男人和玛丽的离奇婚姻开始极大地动摇了两个人的生活。
