世界受“魔甲虫”威胁,大地遭其占据,人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司,是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而,如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天,彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——?由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击,现在启动
在中世纪,炼金术士花费巨资从魔鬼那里获得了传说中的永生之酒。正如它的名字所暗示的那样,那些喝了永生之酒的人,会得到一具永不死亡的尸体。永生之酒带来了希望,但也引发了前所未有的灾难,因为与这种酒有关的个人由于私欲和利益而相继失去了踪迹。