位于被群山环绕受到湿润气候恩惠的“钪纳村”也正在从战争的伤害中重新站起来，受惠于盛产的稻米。但是村里的人们却不能因为米量的丰渥而快乐起来。因为每年都会有黑色威胁“山贼”——过去再战场上风光一时的机械化武士们，数之不尽的席卷而来。战争终结之后的他们早已失去了生活的目的，转而成群结队的去蹂躏村庄抢夺稻米与女人。 抵抗即死--只知道耕作的农民们对于收获期的们的袭击除了无可奈何的接受之外，并没有其它生存下去的方式。对于在收获期之前前来视察稻米状况的山贼，康娜村的长老伪作倡导彻底抗战到底，不过村民们发出了反对的意见。但是伪作早就已经有击退山贼的妙计了，能够对付山贼的只有武士。 就这样血气方刚的少年利吉和分配水的巫女云母及小町姊妹代表村庄朝向沙漠另一方的村庄。虹雅渓展开旅程--对于自小生长在纯朴的康娜村的云母们而言，既杂然又人口众多的虹雅渓是个让他们好奇心与困惑感相互交杂的异度空间，为了拉拢武士所带来的米也被小偷给偷去。从小偷手中将米给夺还回来的是名为了修行而来到了虹雅渓的一个叫做胜四郎的年轻武士。虽然小町和利吉马上就想着要拉拢他，但云母却以“没有战场的气息”为由加以拒绝。 就在这时出现了一名云母一行人认为“就是他了”的武士，其名为勘兵卫，他将在街头上发生的斗殴事件一瞬间的处理完毕并离去。那耀眼的模样让云母直觉地认为他才是能够拯救村庄的真正的武士……
在美国的一个“虚拟太空工厂”里，安吉洛·拉里博士正在研究一个可以快速提高人类智力的“项目5”。在过去的5年里，Angelo博士的研究对象是几只精心挑选的猩猩，实验表明，在虚拟空间的刺激下，猩猩的智力显著提高。“虚拟空间工厂”的负责人蒂姆受幕后投资者的指示，鼓励安吉洛博士使用这种方法刺激黑猩猩原始的暴力中枢神经系统，以增强它们的攻击性，最终创造出比武器更强大的东西。安杰洛坚决拒绝那些战争流氓的妄想，因此投资者拒绝继续投资，安杰洛也面临停牌的困境。安吉洛不愿放弃对“虚拟空间”项目的研究，但他一直在为缺乏研究对象而挣扎。一次偶然的机会，割草工Job出现在Angelo面前。Job患有先天性智力残疾，从小就被一位牧师收养。他遭受着周围环境的欺凌和虐待，只有邻居的孩子彼得愿意和他交朋友。但乔布斯天生乐观善良，安吉洛决心让乔布斯参与实验。安吉洛在乔布斯身上进行了一个月的实验和培训，乔布斯的智商提高了四倍。这个惊人的结果让安吉洛充满了信心，但与此同时，问题也出现了。国内的研究设备已无法满足后续的研究需求。安吉洛不得不求助于蒂姆，希望能秘密借用“虚拟空间工厂”的中央实验室，继续在乔布斯身上进行实验。一方面，蒂姆欣然同意，但另一方面，他在幕后向投资者倾诉。随着研究的进展，安吉洛发现，虽然乔布斯的智力有所提高，但他也表现出了一些超出预期的迹象，比如暴力倾向。因此，他果断地停止了实验。经过调查，Angelo发现Job注射的药物不是他自己配制的，而是一种直接刺激人们剧烈中枢神经系统的药物。原来是蒂姆斯偷偷换的药。事实上，此时的乔布斯已经拥有了一种“用思想控制物质”的神奇力量。他甚至用这种力量烧死了这位看似仁慈、内心阴暗的牧师，并一直在虐待他唯一的朋友彼得的父亲，但没有取得好的结果。此时此刻，安吉洛意识到自己可能伤害了乔布斯，并试图说服他停止进入虚拟空间。但乔布斯已经失去了理智，甚至在智力上超过了安吉洛，独自进行实验。更让安吉洛惊讶的是，乔布斯试图利用虚拟空间来控制整个世界。在关键时刻，安吉洛将炸弹放置在中央实验室，以阻止乔布斯进入虚拟空间。不愿失败的乔布斯拒绝离开实验室，在爆炸声中，实验室瞬间陷入废墟。
