但曾担任联合舰队上尉的哈洛克(Kokuri Seon配音)背叛了盖亚的制裁措施,并驾驶他的阿尔卡迪亚,升起了反政府军的旗帜,成为一名逃亡了一百年的通缉犯。联合舰队司令Isola(森川清治配音)指示他的弟弟Yama(三浦春马配音)潜入阿尔卡迪亚号,探索尼伯龙根人发明的永动机的秘密。在此期间,哈洛克带领他的船员接近地球,而联合舰队则在太阳系中放置了一张网来阻止他的前进。遥远的祖国,久违的真相,震惊了所有人。。。这部电影改编自詹姆斯·松本的经典科幻漫画。
故事发生在位于东京中北部的大岛镇。一个名叫Issey(由Ayama Sasakura配音)的14岁普通女孩和她的妹妹Iseta(由Akira Otsui配音)与年迈的祖父过着相互依赖的生活。尽管生活简单而艰难,但这个家庭最终充满了幸福。