世界受“魔甲虫”威胁,大地遭其占据,人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司,是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而,如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天,彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——?由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击,现在启动
Season2となる本作では、恋への葛藤や性に対するデリケートな悩みを抱えるヒロインたちの揺れる心情を描かれる。
暑假结束时,当时正在学习的五位朋友,森谷信长(前松义弘配音)、加泽秀吉(田坂秀吉配音)、东吉(Hato Yoshiko配音)和椎名林沙(Yoshihiri Yanzoo配音),相约来到望月书院长达三年的分离期,寻找他们当年埋葬的时间胶囊。