2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
Blu-ray & DVD特典动画短片,共6话,每话4分钟。 映像特典 『ぺったんこアニメ』は、BD / DVD各巻に収録の映像特典短編アニメ。『デラ's BAR』は平面キャラになったヒロインたちがデラのバーに来る。
加强反布列塔尼的力量,成为面具反叛者ZERO、黑骑士团的露露秀和被任命为第三公主幼发米亚骑士的朱雀。这两个各自增强了实力的人迎来了命运的转折点。作为第11区副知事,羽生宫宣布成立日本特别行政区。日本实行特别行政区意味着黑骑士存在的意义消失了。