孙悟饭开学在即,琪琪强拖着悟空父子来到闹市区购买衣服。惧内的悟空对琪琪这个兄巴巴的购物狂无计可施,只能任其摆布。正当一家三口共进午餐之时,城市街道接连发生爆炸事件。悟空前往查看,发现肇事者是两个长相怪异之人。
为了保护数码世界和数码兽,四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界,造成了危险和混乱,启人和好友牧野留姬(折笠富美子 配音)、李健良(山口真弓 配音)一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此,朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽,追随着古乐兽的踪迹,启人一行人闯入了数码世界,展开了大冒险。