第2シリーズ。全4話。原作の魔法世界編をもとにしている。OPの絵コンテは赤松健自身が担当。2009年9月15-16日には300名抽選でバンダイチャンネルで第1話の先行ネット試写会が行われる。这个被称为“疫苗世界”的地方在维度上与地球不同，是一个和平稳定的世界，四季如春。有一天，被封在那里的病毒之王“黑暗恶魔”逃跑了，朝着地球的方向逃跑。被这件事困扰的疫苗行业女神玛雅命令学徒守护兽麦丸追捕黑暗恶魔和他们所生的病毒。
