两个失去亲人的少年与一位能看见精灵的少女“有星多江”,以及“须大叔”、“猫又”、“河童”、“座敷童子”等善良可爱的精灵妖怪,一起踏上了寻找亲人的冒险之路,小伙伴们温暖感人的友情故事也就此展开。即使山川异域,跨越时空,这份友情也决不能忘记!小智(松本梨花 配音)带着皮卡丘(大谷育江 配音),和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上,一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴(钉宫理惠 配音)的少女麦亚丽(中川翔子 配音)。胡巴能够制造出神奇的时空圆环,带领大家在不同的地点来回穿梭。