尤仁，一个拥有惊人身体能力的年轻人，曾经过着普通的高中生活，但有一天，他吞下了一种名为“双面糯手指”的特殊诅咒物品，以拯救他的同伴免受“诅咒”的攻击，他的灵魂也登上了诅咒。从此，与被诅咒的“双面诺”同体的虎杖，在最强巫师五条悟的介绍下，被并入了被诅咒的专门组织“东京都拼写高等专门学校”。。。为了消除诅咒，将被诅咒的男孩变成不可逆转的角色的《庄子故事》开始激活--
一位名叫寿日和（小仓唯 配音）的幽灵少女出现在了美月的身边，寿日和告诉美月，自己死于一场交通事故并且丧失了记忆，脑海中唯一能够记得的就是自己非常非常的喜欢夕哉。寿日和附身在了美月的身上，希望能够借助美月的身体帮助自己了却夙愿归天成佛，然而，对于被附身之后态度变得十分奇怪的美月，夕哉究竟抱有着怎样的感情呢？
为了防止犯罪团伙报复他，信义决定匿名并秘密追捕他们，希望能获得解药。有一天，新一的女友Maurilan来到阿里医生家，寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南，然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生，他们一起组织了一支青年侦探队，向罪犯宣战！
