明朝的玉兰公主（罗玉娟配音）去了日本，与那里最聪明的人竞争。一曼将军（刘北辰配音）派一休（王晓燕配音）前去作战，但公主被击败。宜修的聪明和智慧让玉兰对他刮目相看，并坚持要成为他的妻子。无奈之下，宜修只好把玉兰带到安国寺。
然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
幕府时代末期，外忧外患，山川动荡。人民的生活很艰难，他们的生命不断受到威胁。年轻的心太被他善良纯洁的心所打动，成为了飞天剑流的大师。他被他招募来学习剑术，并改名为剑心。
