高中生小木健二是一个诚实内向的数学天才。一个夏天的一天，他被邀请到他姐姐夏Xi美丽的家乡野外工作。原来这份工作的内容实际上是一个伪装成夏Xi的男朋友。该家族的祖先是一个武士家族，他们与德川军团进行了激烈的斗争。
渐渐地，人们开始把那些多次挑战这个大洞穴的冒险家称为“洞穴探险家”。孤儿Liko住在深渊周围建造的“Oss”镇。她梦想在未来成为一名像她母亲一样的伟大探险家，解开深渊的奥秘。有一天，她母亲丽莎的白笛被发现了，这让丽科下定决心要潜入深渊深处。她发现的失忆机器人Reg也决定和她一起寻找自己的记忆。在深王国的四楼，丽可被珍珠穿孔的毒药折磨着，而名为娜娜基的悲剧的结局救了她。Nanaki加入后，三人继续冒险，来到了Pendoldo所在的Deep Realm的五楼。在那里，他们遇到了一个自称普鲁西卡的女孩。在彭多尔多的抚养下，她对外界一无所知。普鲁西卡对利科的冒险故事深深着迷，并希望与他一起冒险，但不幸的是，她被彭多多里用来做实验。然而，后来普鲁西卡改变了她的形态，成为了利科的白笛，与她一起向深境“不归都”的第六关前进。有一个“悲剧结束的村庄”，有自己价值观的悲剧生活在这里。
然而，在混乱时期，愚蠢的统治者亲自摧毁了原始文明，而那些幸存下来的人为了生存选择了暴力。杀戮成了当下唯一的标准。Kenjiro和Yulia在南斗水鸟拳中遇到了Ashi。为了得到他们心爱的女人，阿石想尽一切办法，在健次郎的胸部留下了七道疤痕。失去了心爱的人，面临着人生的第一次磨难，健次郎。。。这部电影根据原哲夫和尊武儒的经典漫画《北斗神拳》改编，是《真正救世主北斗神拳传奇》的第五部。
