地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。
原来，山姆不想出差骚扰假期，取而代之的是他的助理Dickson Lisa，她傲慢果断，而山姆逐渐对她刮目相看，却不敢向她坦白；丽莎的助手想私下获得代理权，并策划了一个阴谋，让本和丽莎在荒岛上无家可归。山姆得知两人失踪后，便出海去救他们。在Sam救出两人后，真相揭晓，Ben和Sam同时爱上了Lisa，最终Lisa选择了Sam。Ben认为这次旅行完全失败了，但公私分明的Sam将经纪公司交给了Ben进行分销
它以古都金泽为舞台，告诉了她再次不择手段攀登顶峰的故事。
