故事的时间设定在西元2001年,由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略,正面临灭亡的危机,因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”,各个国家均派遣了专门人员参与其中,该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 (有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.)
一天,一个神秘的椭圆形物体掉落到了新田义史的房间里,在那里出现了一个美丽的少女雏(田中贵子 配音)。面无表情的雏向新田义史强大的念动力,迫于雏的淫威,新田义史不得不让她以女儿的身份住进自己的家中,就这样,黑社会人事和超能力少女的同居生活开始了。 因为拥有非常强大的力量,雏常常会失控暴走,制造了一堆麻烦留给新田义史来扫尾。起初,“父女”两人之间的关系十分紧张,但随着时间的推移,竟然真的生出的亲情。
在“超级大学级别的绝望”带来的“人类历史上最伟大、最令人发指的绝望事件”下,世界陷入了崩溃边缘的绝望境地。为了拯救这个充满绝望的世界,由希望峰学校前校长和师生组成了“未来机构”。其中有78名学生,其中包括曾击败江之岛敦子的苗木成等人。