有一天，一座城市被摧毁了——拓爷，一名独行侠运输员，和唯一一个在破坏中幸存下来的女孩，小雪。两人依靠小雪父亲的消息，小雪父亲认为根本没有消息，于是开始去消灭这座城市。然而，意想不到的障碍出现在两人面前。
由《怨灵》导演清水隆执导的《恐怖村》系列第三部《牛手村》发布海报，宣布木村拓哉的女儿木村光希将担任主角，这也是她首次登上大银幕！与《犬村》和《树海村》系列的前几部作品一样，《牛头村》也受到了现实生活中超自然地方的启发。
为了保护数码世界和数码兽，四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界，造成了危险和混乱，启人和好友牧野留姬（折笠富美子 配音）、李健良（山口真弓 配音）一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此，朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽，追随着古乐兽的踪迹，启人一行人闯入了数码世界，展开了大冒险。
