在最迷惘的时刻，由乃接到了一份来自间野山市的邀请函，邀请她前往那里就职，而她的职位竟然是“国王”。原来，间野山市曾经作为“迷你独立国”而名噪一时，然而，经济泡沫破裂之后，这个小小的国家便立刻沦为了无人问津的普通观光地。而由乃的任务，就是担任间野山观光协会的会长一职，重振间野山市的辉煌。
三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部，经过多番努力后，终于招募到了新成员龙崎怜（平川大辅 配音），他们以县大赛冠军为目标，进行紧张的集训。另一方面，凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定，要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部，在这个夏天，开始了关于友情与青春的Free!故事。
全人类都害怕。没有异常的人类突然燃烧，变成操纵火焰的怪物“火焰人”，并竭尽全力破坏“人类自燃现象”。面对火焰的恐怖，特种消防队肩负着解开这一现象之谜、拯救人类的使命！出于某种原因，名为“恶魔”的新队员，年轻的森罗，以成为“英雄”为目标，并与同伴一起与“火焰人”进行日常战斗！！
