她变身并被称为朱雀女巫。朱雀女巫的任务是找到传说中的朱雀七星战士，并召唤朱雀来实现她的愿望。随着旅程的展开，朱雀七星逐渐出现，作为一名女巫，她与其中一位名叫贵宿（由绿河之光配音）的人建立了深厚的关系。另一方面，小薇也与美竹跨越了同一个时代，意外地成为了与朱鸟女巫对立的青龙女巫。她还想找到属于她的蓝龙七星战士。起初，一向胆小懦弱的她不想与美珠为敌，但随着她看到美珠和贵柱越来越近，嫉妒慢慢扭曲了她的心。
某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。 在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。
故事发生在一所名为第三届东京西弘NERV的学校，校长是严肃沉默寡言的德川一原（Tomohiki配音）。作为校长的儿子，日娜·真嗣（由绪方惠美配音）感受到了很大的压力。
