为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!
卡利奥斯特罗是欧洲一个只有3500人口的小国,是世界上最逼真的伪钞——山羊纸币的诞生地。它的伪钞的真实性几乎让像鲁邦三世这样的小偷都看不见了。鲁邦和他的同伴来到这里,碰巧遇到了被一群暴徒追赶的漂亮女孩克拉丽斯。