为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!
战国时期,日本被鬼神等未知生命形式统治了150年,但只有“武士团”反抗其统治,并坚持不懈地斗争。武藏和小次郎也向往武士,并发誓有一天会组成最强的武士团。然而,他们居住的城镇将鬼神视为神,并将武士视为异端。
多佩玛告诉小新,自己被邪恶的乔奇莉诺(室井深雪 配音)施下了诅咒只能在晚上现身,而这个马戏团其实是邪恶的马卡欧(大冢芳忠 配音)和裘马(田中秀幸 配音)两人的老巢,而小新拥有能够将他们打败的扑克牌。 害怕的小新并没有答应帮助多佩玛,第二天,幼稚园新来了一位名叫雪人(古川登志夫 配音)的老师,而雪人来这里的唯一目的,就是夺回小新的扑克牌。很快,笑眯眯胖乎乎的雪人就取得了广志和美伢的信任,并下药将他们迷倒。在这千钧一发之际,小新念出了多佩玛教给他的召唤咒语,打败了雪人。