之后，一个神秘的环保组织SKBE掳走了小新一家人，而为首的，竟然是双叶里的里长四膳守（山寺宏一 配音）。原来，四膳首是一位激进的环保主义着，妄图通过一种神秘的药物将破坏环境的人类全部都变成动物，而小新捡到的神秘液体就是还尚处于测试阶段的药物，四膳守准备将美伢和广志当做实验对象进行研究。在神秘女子维多利亚（后藤邑子 配音）的帮助下，小新一行人成功出逃，他们和春日部防卫队一起，决心破解四膳守的阴谋。
故事发生在巨人和人类共存的学校里。艾伦和他的同伴们将与巨人爆发出怎样的故事？
男主人公肖恩（卢卡斯·布莱克饰演）注定是一个失败者，在学校里没有朋友，唯一可以发泄的地方就是街头赛车。在因非法赛车被警方通缉后，他不得不离开美国逃离监狱，前往他父亲在东京的军队中的家中。但他父亲的威权主义让肖恩感到格格不入，仍然每天沉迷于街头赛车。东京赛车极高的漂移技术深深吸引了肖恩，他遇到了“漂移王”DK（由Brian Tee饰演）。由于与日本犯罪集团有牵连，肖恩不得不再次参加比赛以弥补自己的错误，而这场比赛的赌注是他自己的生命。东京飓风已经开始
