从那时起,五年过去了。亚马逊几乎被驱逐,世界正在走向和平。然而,感染亚马逊细胞的普通人的亚马逊化现象继续扩大,政府成立了一个新的4C组织,秘密驱逐亚马逊化的人类。其中,童年时被亚马逊抚养长大并变身为假面骑士的年轻人亚马逊·尼奥对抗亚马逊。它于1881年举行。随着西方化的迅速发展,对政府不满的人数增加,监狱里挤满了囚犯,越狱也被推迟了。然后,政府在滋贺县琵琶湖设立了一个笼子,专门关押重罪犯,以及无法逃到日本的琵琶湖监狱和监狱大门。