故事终于进入了传说中的“圣地十二宫”！！！为了拯救女神雅典娜，星矢座和青铜圣斗士面对教皇率领的黄金圣斗士，双方上演了一场惊天大战！半空之中，漂浮着闪烁着多彩光芒的“知识之箱”，那里面藏着数不尽的世界、时间和人类。杜娅尔（种田梨沙 配音）与多萝茜（佐仓绫音 配音）穿梭于“知识之箱”之中，与侵蚀各个世界的病毒作战。凡是被病毒污染的世界，必须尽快予以消除。
