尽管经济危机得到了缓解,但城市却因长久以来的缺乏管理而陷入了混乱,失业率、自杀率和犯罪率急速上升。 余贺公麿(内山昂辉 配音)的母亲早逝,父亲亦不知所踪,在舅母的抚养下长大成人的他就读于经济学部。家庭温暖的缺失让公麿十分渴望能够拥有一个稳定的家,某一日,他在银行中遇见了一位神秘的男子真坂木(樱井孝宏 配音),男子以公麿的未来作为抵押,借给了公麿大量金钱,公麿就此进入了异空间“金融街”,在那里,有许多和他一样失去了未来的人们,靠着战斗来实现各自的梦想。
2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。