一些过于热心的村长天野义弘（安倍隆饰演）不能坐视这个没有任何生活常识和生存技能的年轻人。他和妻子阿诗子（松田孝子饰演）干预了武史的生活，导致他笨拙地在村里站稳脚跟。这位备受尊敬的祖父（西田敏行饰演）每天都拿着相机，记录着阿武和村民们忙碌的时刻。村长选举在即，上陆车村面临并入其他行政区的风险。与此同时，一个神秘的人（铃木松尾饰演）到来，揭开了与三郎过去鲜为人知的悲伤。。。这部电影改编自漫画家宫子的原作。
多年前，宇宙中最大的恶魔弗利萨（中尾龙胜配音）接连被超级赛亚人击败。他剩下的一行人想在宇宙中漫游，寻找纳姆克人的新定居点，以便再次复活弗利萨。
小智和皮卡丘将一起开始一场新的冒险。。。另一方面，在亚速特王国的超级机构城市，贾维斯部长获得了他多年来一直追求的终极发明——500年前在亚速特王国诞生的人造宝藏克蒙马奇纳。据说，在马吉亚纳邦内部有一种被称为“灵魂之心”的未知力量，贪婪邪恶的贾维斯试图利用这种力量统治王国。小智和波尔克尼恩将如何解决他们之间的分歧？Polkenyon和Majana的起源是什么？他们如何携手对抗贾维斯，拯救亚速特王国？马吉安娜的最终命运是什么？神奇宝贝历史上最伟大的战斗即将开始！
