被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”,并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。它讲述了江户时代晚期日本的故事,由于黑船的出现,江户时代陷入了前所未有的危机。自古以来就存在的巨型机器人“鬼神”的出现,抵抗了外来种族的入侵。