来自冥王星的巨大陨石Tanatos(希腊神话)威胁着地球上人类的安全。为了对抗Tanatos,人类正以国际太阳系开发署(ISDA)为出发点,秘密实施之前未知的开发计划“D项目”。剧情紧接外传 Battlefield of Pacifist(和平主义者的战场),地球与殖民地的战斗于殖民后196年结束。除五飞外,希洛等四位高达驾驶员决心把高达送往太阳丢弃,然而统一的地球圈再次被人类的欲望所吞噬,战乱再一次燃起。