所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了专门除妖的物怪庵，在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。
死亡武器职业专科学校，简称“死亡武器专科学校”。它的学生分为“工匠”和“武器”。据说，通过收集99个鬼神的灵魂和1个女巫的灵魂，“武器”将进化成最强的死亡武器“死亡SCYTHE”。
18世纪上半叶，日本处于德川幕府时代。只能为将军贡献腌萝卜的最小藩主唐长谷刚刚完成年度任务，藩主内藤正纯（佐佐木武藏的中间人）本打算好好休息，但幕府中松裕仁（高野津奈的饰）得知唐长谷发现了金山，因此，他计划迫使北约在五天内再次参加任务，否则他将因叛国罪受到惩罚。北约知道这是一个蓄意的阴谋，仍然决定冒险。在西村Ayahiko和忍者云音段藏（Ihara Gang-zhi饰演）等熟练战略家的协助下，汤长谷的绝望出席正式开始。与此同时，狡猾的松博信树接连派遣间谍，试图阻止奈藤追随者的行程。未来是不确定的。奈藤大人能成功颠覆松弘的阴谋吗？
