柯南、灰原及少年侦探队成员步美、光彦、元太随博士这日露营完毕,绕道参观西多摩市新建于富士山前的日本第一双塔摩天大楼,毛利小五郎恰也应双塔所有者、他的学妹常盘美绪之邀,携小兰、园子参加开幕典礼。故事发生在一个虚拟的幻想世界里。在这里,对应的两个人手牵着手,创造了一种叫做“宁露”的精神联系,这种联系可以成为一种强大的武器。在传说中,有一个上帝控制着这个世界上的一切。只要上帝被击败,心中最强烈的愿望就能实现。