Alan（由Kaji Yuki配音）、Sanri（由Ishikawa饰演）和Ani（由岛村由纪饰演）是住在高墙后面的孩子。艾伦讨厌调查团越来越懒惰的作风，他相信巨人们总有一天会对人类发动更猛烈的攻击。不幸的是，艾伦的预言实现了，一个巨大的巨人打碎了围墙，在人类的最后一片净土上肆虐。灾难发生后，幸存的艾伦和他的团队加入了调查小组，艾伦和桑里发誓要为他们已故的母亲报仇。
少年焰魔堂辘轳（花江夏树 配音）立志要成为史上最强阴阳师，却因为一场悲剧的发生而意识到灾难的不可逆转，遂放弃了理想，沦为路人。 某日，一位名叫化野红绪（潘惠美 配音）的京都少女出现在了辘轳的身边，两人在误打误撞之中开始了同居生活。红绪铲除污秽的决心渐渐感化了辘轳，让他再度看到了希望，燃起了热血。与此同时，辘轳发现，红绪的哥哥石镜悠斗（村濑步 配音）和当年令自己失去一切的灾难有着千丝万缕的关联。
