人类通常采取的措施是用武力来歼灭她们,或者是—— “与其约会,使其娇羞”! 让精灵娇羞,再通过“接吻”即可封印其力量,并转化为自己的力量。拥有这种能力的高中生五河士道,为了人类的和平,也为了拯救精灵们,从而展开了和她们之间的“约会”。士道平时要抑制曾将精灵们卷入斗争的强大灵力,有时为了保护她们也会使用这股力量,通过这样的方式,士道把夜刀神十香等精灵们一次次从危机中解救出来,人类和精灵之间的关系以及处理方法也在悄然改变…… 同时,也有一些组织使用与士道所在的”拉塔托斯克“不同的手段,与精灵们对峙。 短暂的平静即将被打破,士道等人的战争(约会)又要开始了——
本片由三段互无关联的故事组成。《她的回忆》:2092年,由伊瓦诺夫领导的太空垃圾回收飞船在返航途中接收到来自“宇宙坟场”的求救信号,特殊的是,信号中掺杂着歌剧《蝴蝶夫人》的唱段。
从小就不同于普通人的平崎一护(藤仓太饰演),机缘巧合之下遇到了女死神“腐木露琪雅”(杉崎花饰演)。露西娅是灵魂收割者之一,她将灵魂从现实世界引导到尸魂王国。他们一直在与这些怪物战斗,以保护人类免受“虚空”的伤害。