此后不久，特种部队冲进会场，救援行动顺利完成，导致巴中健在混乱中死亡。由于八重健的真正目的尚不清楚，而且在其被杀的过程中也存在谜团，杉田有京（水谷裕中饰）和神户（菊川光博饰）立即展开调查，发现这一切似乎与七年前的一次可能引发国际争端的恐怖袭击有关。另一方面，出于某种原因，高级警官不断施加压力，阻止专案组的调查。层层迷雾背后隐藏着什么惊人的真相？这部电影是同名电视剧的第二部剧场版。
数年后，在人类与“柱”持续战斗的天空中，身披战翼的女武神们以及支援者女武神的男人们，为了拯救世界而拼上性命翱翔天际。日本也不例外，与耸立于灵峰富士的巨大柱对峙的3名女武神。她们每个人都具备强劲的能力，但却都是些问题儿童。此时，一位王牌飞行员因某些缘由从欧洲前来…… “来吧，是反击的时候了，人类。终将来临的决战之日——诸神的黄昏已近在眼前。”
