関わるまいとする涼だが、玲とチームを組むことになってしまい――
Oki医生（石冢云生配音）看到了这种情况，把一只非常顽皮的皮卡丘送给了这个迷路的年轻人，皮卡丘拒绝为精灵球得分。于是，他们两人踏上了精灵宝可梦的旅程。在旅途中，他们的隔阂逐渐破裂，他们遇到了同伴成子（佐藤杂志配音）和宗慈（Hon Koji配音），并听说了凤凰王的传说。在彩虹羽毛的指引下，任何遇到凤凰王的人都将成为彩虹战士。。。“这部剧场版是《精灵宝可梦》动画系列的第20部电影。这部电影的情节改编自动画系列的第一集《精灵宝宝可梦！这取决于你！”，描绘了高知和皮卡丘开始冒险成为神奇宝贝大师的故事。
第二天，柯南（高善男配音）和他的朋友们去东都水族馆观光，却发现了一个美丽的受伤女人（天海佑希配音）。这名妇女处于失忆状态，她的手机也被损坏，无法使用。柯南和其他人承诺会帮助她恢复记忆，但就在他们交谈的时候，隐藏在黑暗中的黑衣组织成员贝尔穆德（小山莫美配音）冷漠地看着这一切。在相处过程中，这个女人非凡的技巧和奇怪的言行让Ashikawara Ai（林惠美配音）质疑她的真实身份。刚才有一个平静的水族馆，那些沉浸在喜悦中的人会认为，随着神秘女子技能的恢复，他们很快就会卷入黑暗组织的杀戮和混乱中
